روز پنج‌شنبه ۲۷ آذرماه ۱۳۹۹، نیروهای امنیتی حمید و حسین افکاری، پدر و برادر نوید افکاری را بر سر مزار او در روستای سنگر بازداشت و به مکان نامعلومی منتقل کردند.
به گزارش تارنگار حقوق بشر در ایران، حمید و حسین افکاری که جهت انجام مقدمات نصب سنگ قبر بر‌روی مزار نوید افکاری به محل دفن وی مراجعه کرده بودند، توسط نیروهای امنیتی بازداشت و ساعاتی بعد آزاد شدند. پیش از این به خانواده افکاری هشدار داده شده بود که حق ندارند بر روی قبر وی سنگ مزار نصب کنند.
نوید افکاری سحرگاه روز شنبه ۲۲ شهریور ماه ۱۳۹۹، باوجود ابهامات فراوان در پرونده‌اش، در زندان عادل‌آباد شیراز اعدام شد.
گفتنی است با وجود گذشت بیش از سه ماه از اعدام نوید افکاری، وحید و حبیب افکاری، برادران وی، همچنان در سلول انفرادی نگهداری می‌شوند و از سرنوشت آنها اطلاعی در دست نیست.
